ละคร MBC พระชายาแห่งศตวรรษที่ 21 ถูกวิพากษ์วิจารณ์อย่างหนักจากประเด็นบิดเบือนประวัติศาสตร์ และป๊อปอัปสโตร์ที่เกี่ยวข้องก็เตรียมยุติการให้บริการก่อนกำหนดเช่นกัน ท่ามกลางกระแสความเห็นด้านลบที่ยังไม่คลาย การจำกัดการจัดกิจกรรมออฟไลน์ยิ่งทำให้แรงสะท้อนตามมามากขึ้น
ฝ่ายป๊อปอัปสโตร์ของ พระชายาแห่งศตวรรษที่ 21 ได้แจ้งผู้จองล่วงหน้าในวันที่ 22 เกี่ยวกับการเปลี่ยนแปลงกำหนดการ เดิมทีป๊อปอัปสโตร์มีกำหนดจัดที่ เดอะฮยอนแด โซล ตั้งแต่วันที่ 19 ถึง 28 รวม 10 วัน แต่ช่วงการเปิดจริงถูกย่อลงเหลือถึงวันที่ 25 เท่านั้น เท่ากับว่าเปิดเพียง 7 วัน โดยเฉพาะการจำหน่ายสินค้า รวมถึงกูดส์ จะมีถึงแค่พรุ่งนี้ (23) ส่วนวันที่ 24–25 จะเปิดในลักษณะจัดแสดงพื้นที่เป็นหลักเท่านั้น
ผู้จัดระบุว่า “ด้วยเหตุผลด้านการปฏิบัติงานหน้างาน จึงจำเป็นต้องเปลี่ยนแปลงกำหนดการและรูปแบบ” พร้อมกล่าวขอโทษต่อการปรับแบบกะทันหัน แม้จะไม่ได้เปิดเผยเบื้องหลังอย่างละเอียดเกี่ยวกับการลดขนาดป๊อปอัปสโตร์ แต่ทั้งในและนอกวงการต่างมองโดยส่วนใหญ่ว่าเป็นผลสืบเนื่องจากกระแสข้อกล่าวหาบิดเบือนประวัติศาสตร์ที่ปะทุขึ้นล่าสุด
พระชายาแห่งศตวรรษที่ 21 ถูกติดขัดเรื่องความถูกต้องเชิงประวัติศาสตร์มาตั้งแต่ช่วงต้นการออกอากาศ และประเด็นมาร้อนแรงระเบิดในฉากพิธีราชาภิเษกที่ออกอากาศก่อนจบไม่นาน ในเรื่อง อีอันแทกุน (รับบทโดย บยอน อูซอก) ปรากฏตัวโดยสวมมงกุฎแบบลูกปัดเก้าเส้นของรัฐบรรณาการ แทนมงกุฎแบบลูกปัดสิบสองเส้นซึ่งถือเป็นสัญลักษณ์ของจักรพรรดิแห่งรัฐเอกราช ขณะที่บรรดาขุนนางก็ร้อง “พันปี” แทน “หมื่นปี” ออกอากาศไป ทำให้ผู้ชมคัดค้านอย่างรุนแรง ยิ่งไปกว่านั้น ชาวเน็ตจีนบางส่วนยังดูเหมือนจะนำฉากดังกล่าวไปใช้หนุนข้ออ้างของโครงการตงเป่ย ส่งผลให้ข้อถกเถียงขยายวงกว้างขึ้น
ท้ายที่สุด ไอยู และ บยอน อูซอก ตลอดจนผู้กำกับและนักเขียนได้ออกมาขอโทษด้วยตนเอง ขณะที่ทีมผู้ผลิตก็ได้ดำเนินการลบฉากปัญหาออกแล้ว กระนั้น กระแสวิจารณ์ก็ยังไม่สงบลงง่าย ๆ บนกระดานรับความเห็นผู้ชมและชุมชนออนไลน์ถึงขั้นมีการพูดถึงการยกเลิกละคร และความเป็นไปได้ในการเรียกคืนเงินสนับสนุน
หลังละครลาจอไปแล้ว ทั้งการจัดผังรีรันและการดำเนินงานป๊อปอัปสโตร์ที่ตามมาได้กลายเป็นประเด็นถกเถียงต่อเนื่อง ทำให้แรงสั่นสะเทือนรอบ ๆ พระชายาแห่งศตวรรษที่ 21 มีแนวโน้มจะคงอยู่ต่อไปอีกระยะ